7 maart 2011
Bio-informatica: van gegevens naar kennis
Prof.dr. P.J. van der Spek
(Erasmus MC, Rotterdam)
De afdeling Bioinformatica van het Erasmus Medisch
Centrum heeft een eigen researchprogramma, dat de
biologische en technologische basis verschaft voor al
haar andere activiteiten. Dit programma richt zich op
de wijze waarop het genoom als geheel bijdraagt tot
de evolutie, ontwikkeling, structuur en functie van de
hersenen. Dit houdt in de analyse van de (volgende
generatie) sequencing data, promoter/enhancer data,
copy number variatie en genexpressie in meer dan 50
verschillende regio’s van de menselijke hersenen.
Met deze benadering beogen wij een integratie tot stand
te brengen van genomics, proteomics en cytogenetische
data met de gegevens van moderne beeldvormende
technieken, ten behoeve van de identificatie van
genen die geassocieerd zijn met neuro-ontwikkeling,
neuro-degeneratie en neuro-oncologie. De koppeling
van moleculaire en beeldvormende technieken opent
nieuwe wegen voor beeld-gestuurde diagnostiek en
interventies. Dergelijk functioneel genomics onderzoek
vereist de kennis en vaardigheden van experts op het
gebied van systeem biologie en bioinformatica.